Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tff1Q08423 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tff1Q08423 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tff1Q08423 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tff1Q08423 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tff1Q08423 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tff1Q08423 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tff1Q08423 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tff1Q08423 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms