Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms