Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Gm11266-201ENSMUST00000139835 1271 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Asb11-202ENSMUST00000036858 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 AC123735.1-201ENSMUST00000227358 605 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Eqtn-201ENSMUST00000030309 1074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Olfr434-201ENSMUST00000076752 1056 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Siah2Q06986 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms