Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Siah1bQ06985 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms