Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Thbs3Q05895 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Thbs3Q05895 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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