Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms