Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl7Q03366 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms