Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1sQ02789 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms