Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NfiaQ02780 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms