Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gjb4Q02738 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms