Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GscQ02591 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GscQ02591 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms