Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxd1Q01822 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms