Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

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Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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HmgcrQ01237 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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HmgcrQ01237 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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HmgcrQ01237 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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HmgcrQ01237 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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HmgcrQ01237 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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HmgcrQ01237 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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HmgcrQ01237 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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HmgcrQ01237 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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HmgcrQ01237 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms