Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col1a2Q01149 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms