Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms