Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gys1-201ENSMUST00000003964 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cited1P97769 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cited1P97769 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms