Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SmsP97355 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SmsP97355 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SmsP97355 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SmsP97355 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SmsP97355 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SmsP97355 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SmsP97355 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SmsP97355 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SmsP97355 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SmsP97355 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SmsP97355 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SmsP97355 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SmsP97355 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SmsP97355 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms