Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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SgcdP82347 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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SgcdP82347 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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SgcdP82347 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcdP82347 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgcdP82347 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcdP82347 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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