Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Irx1P81068 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irx1P81068 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms