Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irx3P81067 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms