Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx2P81066 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx2P81066 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx2P81066 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx2P81066 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx2P81066 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx2P81066 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx2P81066 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx2P81066 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx2P81066 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx2P81066 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx2P81066 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx2P81066 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx2P81066 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx2P81066 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx2P81066 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx2P81066 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx2P81066 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx2P81066 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx2P81066 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms