Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp9xP70398 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
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