Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SbdsP70122 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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