Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Crip1P63254 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Crip1P63254 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Crip1P63254 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms