Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab3cP62823 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab3cP62823 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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