Protein–RNA interactions for Protein: P62313

Lsm6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm6P62313 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lsm6P62313 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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