Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SnnP61807 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SnnP61807 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SnnP61807 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SnnP61807 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SnnP61807 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SnnP61807 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SnnP61807 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SnnP61807 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms