Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Vbp1P61759 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Vbp1P61759 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
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Vbp1P61759 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Vbp1P61759 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Vbp1P61759 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Vbp1P61759 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Vbp1P61759 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Vbp1P61759 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vbp1P61759 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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