Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms