Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp25P57080 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp25P57080 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp25P57080 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp25P57080 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp25P57080 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp25P57080 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp25P57080 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp25P57080 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp25P57080 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp25P57080 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp25P57080 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp25P57080 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp25P57080 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp25P57080 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp25P57080 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp25P57080 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp25P57080 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp25P57080 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp25P57080 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp25P57080 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp25P57080 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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