Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Nedd4P46935 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nedd4P46935 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nedd4P46935 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nedd4P46935 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nedd4P46935 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nedd4P46935 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nedd4P46935 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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