Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms