Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms