Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
VhlP40338 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
VhlP40338 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
VhlP40338 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
VhlP40338 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VhlP40338 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VhlP40338 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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