Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rab5cP35278 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Rab5cP35278 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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