Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tfap2aP34056 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms