Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Saa4P31532 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Saa4P31532 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms