Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pde6aP27664 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pde6aP27664 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pde6aP27664 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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