Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ggta1P23336 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms