Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gja1P23242 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gja1P23242 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms