Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim1P20664 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim1P20664 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim1P20664 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim1P20664 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prim1P20664 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms