Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms