Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18530 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18530 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms