Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18525 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18525 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18525 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18525 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18525 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P18525 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18525 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18525 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18525 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18525 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18525 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18525 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18525 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18525 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18525 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18525 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18525 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18525 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18525 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18525 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P18525 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18525 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18525 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18525 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18525 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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