Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sptan1P16546 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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