Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irf1P15314 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Irf1P15314 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Irf1P15314 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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