Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtcP11725 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms