Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TtrP07309 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TtrP07309 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
TtrP07309 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
TtrP07309 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
TtrP07309 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TtrP07309 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms