Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06323 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P06323 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06323 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms