Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-Ab1P01921 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms